肛门有蛲虫，主要就是通过口服杀虫的药物进行对症的治疗，在临床上比较常用的有甲苯咪唑，属于广谱的杀虫药物。另外，还可以口服阿苯达唑片，也就是肠虫清，可以杀死成虫以及幼虫。还可以使用一些中药进行对症的治疗，比如使用使君子去外皮或炒熟，然后进行口服。
其次，出现肛门局部症状的，还可以使用药物进行对症的治疗。局部可以使用氧化锌软膏进行涂抹，或者是使用除湿止痒软膏进行涂抹，可以防止出现瘙痒的情况，并且减少自身的感染。
最后，还可以使用灌肠的方法将蛲虫刺激排出。