磁共振的检查有助于检查甲亢的病因。甲亢分为原发性的甲亢和继发性的甲亢，原发性的甲亢通常指的是甲状腺本身的病变而导致的甲亢。
如果通过甲状腺功能的检查能够明确是原发性的甲亢，这时一般不需要行磁共振检查来查找甲亢的病因，需要完善的检查，包括要行甲状腺b超、甲状腺相关抗体测定、甲状腺ECT或者吸碘率的检查等。
如果甲功的检查提示是继发性的甲亢，常见的病因是垂体的TSH瘤引起的甲亢，对于这种病因需要行垂体的磁共振来明确有没有垂体的腺瘤，这种属于甲亢病变部位的查找。