肾穿刺对身体有一定的危害。但如果能够严格地掌握肾穿刺的适应证、禁忌证，严格地按照操作规程进行，绝大多数的肾穿刺患者是比较安全和平稳的。肾穿刺对于肾脏疾病的诊断有非常重要的临床意义，可以明确肾脏的病理损害类型指导治疗和判断预后。而肾穿刺对于人体的危害，因为肾穿刺是有创检查，个别人就会出现并发症，而对身体造成一定的危害。
1.肾穿至局部的疼痛给患者造成心理负担，通常情况下都能够缓解。
2.血尿是最常见的并发症，可以是肉眼血尿、镜下血尿以及动静脉内瘘的形成，严重者导致了贫血，就需要进行特殊的干预治疗，以免加重病情。
3.穿刺后的包膜下血肿、较大的血肿完全吸收时间大约需要1~2个月。个别巨大的血肿会继发高血压和肾功能的不全，出现腰疼、腹痛而增加了卧床的时间和痛苦。
4.穿刺过程中误伤了其他的脏器。
5.极个别的患者会出现继发的感染。