自体脂肪移植也是有风险的，毕竟这种手术是需要将自体脂肪抽取出来，经过纯化离心，再注射到新的位置。整个操作的过程中如果被细菌污染，就会导致填充的脂肪感染，吸脂的位置也会相应出现感染、脂肪液化的变化。对于吸脂的位置以及填充的位置都会造成明显瘢痕的残留，以及局部的凹凸不平。
由于自体脂肪抽吸相对在抽吸量方面并没有特别大，所以发生脂肪栓塞的风险不高。但是在推注脂肪的过程中却容易发生脂肪的栓塞。
所以求美者一定要选择在正规的医疗机构完成这项手术，并且在手术后严密观察填充位置的形态，防止出现异常固定，对于自体脂肪塑形产生不利影响。