对于急性细菌性睾丸炎要全身使用抗菌药物。在抗菌药使用之前，首先要采集尿液、标本进行细菌学的检查，以指导临床的用药。
在临床上，通常用以下的几类抗生素：
1.喹诺酮类代表药物有加替沙星。左氧氟沙星、环丙沙星等；
2.大环内酯类的药物。具体药物有红霉素、阿奇霉素、克拉霉素等；
3.头孢类药物的代表性药物有头孢三氢头孢肟钠、头孢曲松钠等；
4.氨基糖苷类的药物虽然这类药物疗效好，但是由于有明显的不良反应，所以很少在临床应用；
这些抗生素在临床用药时间不应该少于一到2周的时间。