小儿营养不良会引起很多与营养缺乏相关的疾病，最常见的包括贫血，维生素A、维生素D的缺乏、感染、脓毒血症等，引起这些疾病的原因是因为营养不良造成体内缺乏很多营养素。
无论是六大营养素，还是微量元素，任何一方面严重的缺乏都会造成机体的相关疾病。长期的营养不良会明显地影响小儿的身体生长发育，包括各个系统、器官的功能。孩子会表现为身高、体重的下降，免疫力的下降。
造成营养不良的原因，一方面是由于摄入不足，另一方面也是各种原因造成的营养丢失过多。所以从治疗上要及时地给予补充，才能有效地防止小儿营养不良。