小孩发烧39℃，手脚冰凉，大多是由于病原体感染所导致。
当病原体，比如细菌、病毒、支原体等，进入孩子体内，会随着血流进入大脑，影响到大脑的体温调节中枢，体温调节中枢的调体温调定点上移，从而导致孩子出现发烧，体温可以高达39℃。
如果孩子在39℃的情况下伴随手脚冰凉，说明孩子的发烧还处于一个上升期。
一般孩子发烧分为两个阶段，
第一个阶段为体温上升期，
第二个阶段为体温平台期。当体温上升期时，机体为了产热会减少热量的散失，使得周围血管收缩，所以手脚就表现为冰凉，说明孩子的体温有可能会进一步升高。