肾脓肿有后遗症。
未有效抗炎治疗的情况下，脓肿溃破而导致肾周围间隙感染，腰背部疼痛、发烧等症状加重，也有可能发展为败血症等危急情况，对肾脏功能可造成明显影响，进而对机体其他各大脏器功能也会造成不同程度影响。
明确脓肿诊断后，可在超声引导下穿刺脓肿，引流脓性分泌物。脓腔清洗、药物灌注等处理，并且还需要结合血象变化情况，静脉点滴方式给以敏感抗生素，可在短时间内达到有效的血药浓度，及时控制感染而促使脓腔炎性分泌物消散吸收。