肺炎后期可能会出现咳嗽加重现象，主要原因有：
可能是因抗感染治疗不当导致的病情加重，通过实验室检查结果，如血常规、白细胞或C-反应蛋白明显增高，需要更换抗生素对症治疗。可通过做药敏试验选择有效地抗生素治疗，经过治疗后咳嗽可能会明显减轻。
另外，可能是由于经过有效地抗感染治疗，短暂时间后仍然会出现咳嗽加重，感染了支原体肺炎咳嗽的时间较长，需要在抗感染治疗同时，使用止咳、排痰的药物对症治疗，如服用丙卡特罗、氨溴特罗等缓解病情。也可以用雾化吸入的疗法，止咳效果比较明显。