幽门螺旋杆菌一般需要用药2周左右。在治疗幽门螺旋杆菌用药时，一定要严格按照医嘱足量、足疗程使用，以免因药物使用剂量不当或者是盲目停药，而加重所出现的症状。
目前，常使用四联疗法进行治疗，一般为铋剂加质子泵抑制剂加2种抗生素。但是，具体的药物类型及剂量，需要在医生面诊后进行决定。必要时，也可以进行药敏试验，选择敏感的抗生素类药物。
使用药物进行治疗，结束后需要复查碳13或者碳14呼气试验，了解幽门螺旋杆菌的根除情况。