拉完大便肛门有肉球还疼，可能是以下的原因导致：
1.痔疮。拉大便的时候腹压增高，会造成内痔脱出肛门形成肉球，导致充血、水肿，会引起肛门疼痛。合并感染时也会引起疼痛感加重，外痔也会造成肛门外有肉球，如果形成血栓时也可导致疼痛。
2.直肠黏膜脱垂。直肠黏膜脱垂也可诱发大便之后有肉球，在早期脱出的时候会自行还纳进肛门。如果脱出时间比较长，继发感染，也可导致疼痛。
3.肛乳头瘤。排便后会造成肛乳头瘤脱出肛门形成肉球，疼痛比较明显。
建议去肛肠科检查一下，确诊其原因，再给予对症治疗。