如果儿童时期发现的肩胛骨一高一低，可能是先天性高肩胛症。1岁左右儿童开始行走的时候就会发现一侧肩膀比另一侧高，通常还伴有胸部脊柱等部位畸形，轻微高肩胛症可以给予保守治疗，严重的一般需要行手术治疗。
其次，可能是因为脊柱侧弯导致的，可以在背部发现脊柱明显偏向一侧，通常肩胛骨发育正常，轻微的脊柱侧弯可以给予按摩推拿或主动锻炼背部肌肉，外固定支架固定侧弯部位，如果严重的脊柱侧弯就需要行手术治疗。
如果成年人发现肩胛骨一侧高一侧低，还可能与平常不良生活姿势引起的。需要积极改正不良姿势，加强腰背部肌肉功能锻炼。