新生儿咳嗽一般是不会自愈。
因为新生儿年龄较小，抵抗力较差以及呼吸系统发育不成熟。新生儿有咳嗽，一般是急性上呼吸道感染，如果不经过处理继续加重，病毒或细菌就会感染下呼吸道，容易引起急性支气管炎、支气管肺炎等。有咳嗽的症状时，可以多喂点温开水，新生儿睡觉时喉咙有响声提示有痰，可以口服止咳化痰药。
新生儿由于年龄较小，症状不典型，有时候病情程进展速度比较快，必要的时候需要到医院进一步诊断治疗，以防止支气管肺炎和并发症的发生。