衣原体反复发生感染，需要积极采取大环内酯类的抗生素进行治疗，比如阿奇霉素。除此之外，也可以应用红霉素、四环素、米诺环素、多西环素等药物进行治疗。
如果病情比较严重，也可以应用糖皮质激素。具体的用药情况，需要根据病情来选择。对于一些免疫力较差的患者，治疗需要花费更长时间。
不可以感觉症状有所好转，就认为已经痊愈并且停药，这也是病情容易反复发作的原因之一。治疗之后，还需要对衣原体感染的证据进行评价，判断其是否彻底消失。