肠瘘时首先应该根据相关辅助检查，如口服亚甲蓝、瘘管造影、X线钡餐或肠灌肠检查等，以确定肠瘘大致的部位。
对于瘘口局部可以使用凡士林纱布填塞，或者医用粘合胶注入法堵塞肠瘘，以及肠管内外橡皮片堵压法等，对于低位瘘和小瘘可自行愈合。注意保护瘘口周围皮肤，注意清洁卫生，局部周围皮肤可以涂抹一些药膏，防止皮肤发生糜烂、潮红及感染。
同时还需要注意改善营养状况，对于漏出来较大者，可设法将瘘口流出的肠液还纳于肠腔内，对于不能自行愈合的，也可以根据具体情况采取手术治疗。