吞口水时喉咙痛常见于急性咽喉炎、急性扁桃体炎和急性会厌炎的患者，这类疾病均属于上呼吸道感染性疾病。主要是由于机体抵抗力下降，导致细菌、病毒等致病微生物乘虚而入引起。
患者出现吞口水喉咙痛的症状时，应该根据致病微生物不同给予抗病毒或者抗菌药物治疗，一些中成药效果也不错。对于急性会厌炎患者有可能因为会厌高度肿胀引起呼吸困难，除了上述治疗外，还应尽快给予激素喉部雾化吸入减轻水肿。
此外，疾病期间还应该多喝水，饮食宜清淡，并避免进食坚硬和温度过高的食物，以免损伤粘膜。