肛周脓肿手术后可以排便。肛周脓肿患者，无论行单纯的切开引流术或者一次性根治术，均可以排便，并不会对患者肛门的通畅性造成影响。
由于手术切口距离肛门比较近，特别是一次性根治术术后患者，手术切口和肛门是相通的，所以在排便的过程中，有可能会引发切口出现疼痛，但大多并不剧烈。
由于排便时粪便会污染手术切口，所以肛周脓肿术后患者排便后，需要特别注意肛门切口的清洁与消毒。在便后可以使用高锰酸钾溶液坐浴，坐浴完成后应立即切口换药，防止切口内积存粪便，而影响切口的愈合。