跑步时腿关节疼可以是由于以下几种原因引起：
1.劳累。如果跑步过多或者跑步的强度过大，就可以导致腿关节过度疲劳、劳累，而出现关节疼痛，这时要注意休息，减少运动量，能够有效减轻关节疼痛。
2.关节自身疾病。比如关节的骨性关节炎，或者风湿、类风湿等，也可以在跑步时出现明显的腿关节疼痛。
3.关节周围韧带、软组织的慢性损伤。比如关节周围的肌腱炎，就可以出现在跑步时关节周围疼痛。在跑步时可以有明显韧带止点处的疼痛，查体时可以有压痛，在核磁共振上可以看到有炎症的表现。这时要通过核磁共振等检查进一步诊断，应给予相应的对症治疗。