引起慢性间质性肾炎的原因有很多，慢性间质性肾炎治疗的目的就是促进肾功能的恢复、延缓肾功能进展。
关键要控制原发疾病，要治疗各种诱发因素。比如由非甾体抗炎药物、马兜铃酸药物引起的肾损害，需要停止使用这些药物；如果由于肾结石、输尿管狭窄导致的泌尿系统梗阻，需要积极的手术治疗，解除梗阻因素；如果出现高钾血症，应当使用降低血钾的药物，比如使用利尿剂。
如果患者血压低，血容量不足，需要补充血容量，补液治疗；如果患者出现尿路感染，有尿频、尿急、尿痛，需要使用抗生素治疗；如果血压升高，使用降压药物；如果存在贫血，使用促红细胞生成素；一旦到达尿毒症，需要透析治疗。