角膜溃疡时会有后遗症。主要的后遗症就是在角膜上残留云翳、斑翳或者导致角膜直接形成角膜白斑，从而对患者的视力造成影响。而具体溃疡愈合后会形成什么，主要和发病时期的角膜溃疡深度有关。
一般比较浅层的角膜溃疡愈合之后会在角膜上残留颜色较淡的云翳，这个时候对患者的影响还不是很大。但是角膜溃疡较深的时候，愈合后就会导致局部形成斑翳，斑翳的颜色较深就会影响到患者的视力。
而溃疡时期的时候出现过穿孔，愈合后就会形成角膜白斑，这种情况对视力影响极大，可能需要角膜移植治疗。