咽囊炎和咽部囊肿的区别，主要有下列几种：
1.疾病的种类不同。咽囊炎属于一种炎症感染性疾病，是由于炎症对于咽囊部位的感染，导致咽囊部位出现了脓肿的情况；而咽部囊肿，属于一种增生性物质；疾病的发病与咽喉部位长期慢性的炎症感染、细胞的死亡、皮屑的脱落等因素有关。
2.疾病的治疗方式并不相同。咽囊炎的治疗，除了使用手术治疗的方式以外，还可以选择通过穿刺抽脓以及局部涂抹药物等方式来进行处理；但是咽部囊肿的治疗，则主要以手术治疗为主。