慢性结肠炎的患者，如果以腹痛、腹泻为主要临床表现，需要给予止泻的药物，如蒙脱石散以及肠道微生态制剂。选择敏感的抗生素，如环丙沙星、甲硝唑抗感染治疗。也可以应用抗生素保留灌肠，必要时可使用激素，如地塞米松。
如果腹痛比较明显，需要给予抗胆碱的药物解痉止痛、解除肠道的痉挛，以便秘为主的需要给予润肠通便的药物治疗。
结肠息肉如果没有临床症状，息肉的体积较小，可以定期做肠镜观察，不用特殊治疗。如果息肉的数量较多，体积较大，需要手术将息肉切除，手术后定期复查。