复合性酸碱失衡的治疗需要纠正原发病，并且纠正当时酸碱失衡治疗。呼吸性酸中毒合并代谢性酸中毒，一般有阻塞性肺疾病，同时发生中毒性休克，有乳酸酸中毒。
呼吸性酸中毒合并代谢性碱中毒，一般由慢性阻塞性肺疾患发生高碳酸血症，又因肺源性心脏病心力衰竭而使用利尿剂引起代谢性碱中毒。呼吸性碱中毒合并代谢性酸中毒，一般由肾功能不全、肝功能不全以及水杨酸剂量过大而引起的。
呼吸性碱中毒合并代谢性碱中毒，一般是由发热、呕吐过度、通气而造成以及肝硬化腹水。代谢性酸中毒合并代谢性碱中毒，一般由于急性肾功衰竭有呕吐或行胃吸引术可造成。