含牙囊肿是否需要住院治疗，取决于含牙囊肿发生病变的部位、病变的大小、选择治疗的方法和手术方式。如果含牙囊肿位于颌骨前部，发生在成年人，手术可以在局麻下进行，这种就不需要住院。在局麻下手术，手术结束以后，很快患者可以回家。
有些含牙囊肿，比如发生在上颌后部、下颌后部，或者因为含牙囊肿的体积比较大、手术的创伤比较大，局麻下难以完成。还有一部分含牙囊肿，发生在儿童和青少年时期，一般局麻手术患者难以配合。上述这些情况，往往这种手术的治疗需要全麻下进行，就需要住院。手术以后做评估进行全麻，全麻术后要进行恢复和麻醉康复，然后再出院。
有些比较大的含牙囊肿，选择进行开窗减压治疗，让这个手术变小，让囊肿变小，这种情况下可以把一个大手术变成一个局麻，不需要住院的小手术，以后二期再进行治疗。如果比较大的含牙囊肿直接进行刮治手术，多数情况下是需要住院的。如果进行袋型开窗减压术，有可能在门诊局麻下就能完成。