狭颅症的并发症有头痛、智力低下、肢体活动不灵活等。由于狭颅症是各种原因引起的颅骨过早闭合，但是此时脑组织多还处于发育阶段，所以过早闭合的颅骨就会压迫脑组织引起不同的并发症包括：
第一，头痛。颅骨过早闭合后、脑组织继续发育引起颅内压力升高，过高的颅内压刺激引起头痛。
第二，智力低下。由于颅骨限制脑组织的发育，所以患者会出现脑部发育变慢，当脑组织发育迟缓后就可能出现智力低下的症状。
第三，肢体活动障碍。当脑部控制运动的脑组织被颅骨压迫，就可能出现功能障碍，表现为胳膊、腿活动不灵活。
为了避免出现后遗症，所以狭颅症需要早期治疗。