绝大多数的乙肝患者寿命是接近正常人群，不会缩短。只有极少数的患者由于没有进行有效的抗病毒治疗，使病情进展为肝硬化或肝癌才会缩短寿命。
乙型肝炎是肝硬化和肝癌的高发人群，肝硬化和癌变与病毒载量是呈正相关的。积极有效抗病毒治疗，可以降低肝硬化和肝癌的发病率。但是，患者如果一旦发展为肝硬化或肝癌，会出现多种严重的并发症。如肝硬化时可以出现食道胃底静脉曲张出血而危及生命，或者是肝性脑病、肝肾综合征等也可以危及生命。
肝癌如果早发现、早诊断、早治疗尚能挽救生命，否则通常会危及生命。