肝部分切除术是目前公认的治疗肝内胆管结石的最有效的方法，这种方法能够彻底清除肝内病变胆管，因此手术后应该进行定期随访，同时也应当进行系统的利胆排石治疗，这样就可以减少肝内胆管结石手术后的复发率，减少不必要的麻烦。
肝内胆管结石因饮食生活习惯不良，还有就是胆汁代谢成分的改变，以及胆道感染等引起。建议少食辛辣刺激，多吃蔬菜水果粗粮，忌高脂肥甘，多喝水运动，饮食规律。
口服胆通、消炎利胆片，以及熊去氧胆酸的溶石治疗。定期复查B超，这样对病情的进展和治疗都是有帮助的。