佝偻症是一种全身性的代谢疾病，会对全身的多个系统器官造成影响，比如消化系统、神经系统，其中尤其是对骨骼的影响比较大。
最主要最常见的原因是维生素D缺乏导致，维生素D缺乏会影响到体内的钙磷代谢，从而影响到骨代谢，造成骨质不能正常地矿化，产生骨骺的过度生长，出现骨质变软，最终会出现骨骼的畸形。
另外还有一些特殊的原因，比如抗维生素D性佝偻病，是属于一种基因遗传性疾病，包括低血磷性的抗维生素D佝偻病，以及低血钙性的抗维生素D佝偻病，都是属于遗传性的疾病。再有如果出现了胃肠道功能障碍以及肾功能出现异常，也会影响到体内的钙磷代谢，从而产生佝偻症样的骨代谢异常。