男性阴茎根部出现不适症状，首先考虑存在慢性前列腺炎的可能。
慢性前列腺炎作为男性常见疾病，其临床表现复杂多样，除了会表现为尿频、尿急、尿痛、尿不尽、尿等待、尿分叉等排尿不适症状之外，还会表现为会阴部、腰骶部、阴囊睾丸、阴茎周围胀痛不适。由于神经分布的原因，这种胀痛的感觉并没有特别明确的界限，有的就仅表现为阴茎根部周围不适症状。
另外，泌尿道感染、尿道结石，尤其是前尿道结石，容易出现阴茎根部不适。阴茎根部不适感也有少数为输尿管下段结石所导致。