传染性软疣可以根治，大多数患者在6~9个月内可以自行消退，有一些患者也可能持续3~4年左右。
如果长时间没有自己消退，一般可以外用一些软膏进行治疗，主要是抗病毒的药物。一些水杨酸类的软膏也可以治疗，也可以配合免疫调节药膏治疗。
除了外用的药膏，也可以通过激光手术的办法，或者通过直接挤压刮除进行治疗。但是疾病有可能复发，平时一定要注意个人的清洁卫生，注意局部皮肤清洗。多吃一些富含维生素A的食物，不可以多吃辛辣刺激性的食物，也不可以喝酒。