女性出现胚胎停育要做的检查项目，一方面是针对导致胚胎停育的病因，所进行的检查，另一方面则是要进行胚胎停育清宫手术所需要的术前检查。
与胚胎停育的病因相关的检查，一方面包括胚胎的染色体检查，以及夫妻双方的染色体检查。如果女性发生了2次或者2次以上的胚胎停育，建议进行夫妻双方的染色体检测。如果胚胎停育发生2次以上，还建议进行胚胎本身的染色体检测。
另外要进行女方的感染方面的检测，其中包括弓形虫、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、风疹病毒等。自身免疫性抗体的检测，也是针对胚胎停育的病因进行的检查项目，而对于手术要做的检查，则包括血常规、凝血功能的检测、肝肾功能的检测等。