肾囊肿5cm处理措施如下：
1.不要喝刺激性的饮料，比如浓茶。也不要吃辛辣的食物，比如大葱、生姜。
2.平常不要做剧烈的运动，不要去人多的地方拥挤，要避免腰部、腹部撞击。
3.可以选择在超声引导下行肾囊肿穿刺术。将囊腔中的囊液抽取完毕以后，再向囊腔中注射硬化剂，随后抽取硬化剂，这种方法创伤小，术后能够下床活动。
4.如果肾囊肿反复发作，还可以选择外科手术治疗，也就是全麻下通过腹腔镜进行肾囊肿去顶减压手术，该种手术优点是不易复发。
5.术后3月观察囊肿的变化。