卵巢囊肿在临床上个别的可能会发生恶性变，比如卵巢畸胎瘤的情况下，有可能会发生恶性变。
所以对于卵巢囊肿，如果有手术指征的情况下可以考虑尽快做手术治疗，并且将切除的囊肿送病理化验，临床以病理诊断为准。在术后也建议要定期地给予复查，主要是了解术后的情况，并且了解局部是否有复发的可能性。
如果是卵巢囊肿，没有手术指征的情况下，建议一定要定期的追踪、随访。可以在没有临床症状的情况下，每半年做一次B超检查了解卵巢囊肿的生长速度，有没有可疑发生恶性变。并且也建议必要的时候做妇科肿瘤三项的化验检查来了解是否有异常，然后再决定下一步的处理方法。