磁共振仪器检查本身对人体以及器官没有任何伤害，对于肝脏没有什么损伤。
在做磁共振时，因为检查舱的空间比较狭窄，而且低矮，可能会有封闭窒息的感觉，特别是在检查过程中，磁共振的机器工作时噪音非常大，让人难以忍受，可能会有一种非常烦躁的感觉。
肝脏核磁共振主要是包括平扫核磁共振和增强核磁共振，平扫核磁共振非常简单，患者并不会出现不适症状，但是做增强核磁共振，由于患者需要应用造影剂，有可能出现一定的不良反应。