颅内感染高烧不退，有很多种原因，主要是病情重、感染严重，没有控制好或者是耐药细菌感染，具体要根据病情来分析判断。
颅内感染出现持续高烧39℃、40℃，往往这种情况病情非常严重，有可能颅内压很高，脑脊液甚至呈脓性，脑脊液腰穿的时候，做培养可以发现很多致病细菌。
有些时候致病细菌是一些广谱的耐药细菌，比如鲍曼不动杆菌，这种情况下，往往治疗起来就非常的棘手，也很被动。这种情况有些时候不能够完全治好，随时都可能会死亡或者是导致高度的功能残疾。