颊癌鉴别诊断标准是组织病理学为金标准，还可以根据临床表现跟一些疾病相鉴别，但是最终以病理学组织报告为最终诊断。
早期颊癌的糜烂和溃疡表现应该与糜烂型的扁平苔藓粘膜慢性溃疡，尤其是残根、残冠这些慢性刺激引起的褥疮性溃疡相鉴别。后者在手术拔除残冠、残根或者消除刺激因素之后，疼痛就会很快减轻，溃疡也会缩小愈合。
对于颊癌伴有局部肿胀、张口困难、活动受限的患者应该跟单纯感染，特别是和椎间隙的慢性感染以及低毒性边缘下颌骨骨髓炎相鉴别。