妊娠合并偏头痛在妊娠期偏头痛仍继续发作或妊娠期首次发作，应考虑非血管舒缩功能障碍。局部可能有某种更严重病因存在，如血管发育异常或有生长缓慢的肿瘤等，应做头颅CT或MRI检查，以明确诊断。
对常见类型的偏头痛诊断无困难，其根据是长期反复有发作史、家族史和体检正常。若试用麦角胺制剂止痛有效，则诊断更加明确。
与颅内占位性和血管性病变鉴别中，任何头痛患者均需经过详细神经系统检查以排除占位性病变。必要时须进一步检查，如脑血管造影、CT、MRI等。