早上起来就频繁咳嗽的原因有很多，首先要注意排外有无肺部慢性疾病而引起，例如慢阻肺、慢性支气管炎、支气管扩张等。此类患者晚间咳嗽、咳痰情况减少，使其痰液积聚于支气管内，早上起来时痰液要咳出而诱发患者频繁的咳嗽。
部分支气管哮喘的患者因清晨早起时气道敏感性增加，也会导致其咳嗽程度的加重，有时还可以因慢性咽喉炎而引起晨起咳嗽。部分患者还有可能因睡眠呼吸暂停综合征而导致的早上咳嗽厉害，因为晚间睡觉时反复发生呼吸暂停和打鼾的现象，早晨起床时因咽喉部不适诱发其出现频繁的干咳。
故对于晨起就频繁咳嗽的患者，要根据具体病情和辅助检查来确定原因。