肛门湿疹还是有可能自愈的。能自愈的肛门湿疹一般都属于继发性的，这类湿疹一般都是由于肛门皮肤长时间处于潮湿、粘腻的环境里，或者是由于肛门渗液长时间刺激肛门皮肤导致发生的。
常见于晚期的内痔、直肠粘膜脱垂、肛周脓肿、肛瘘等疾病，所以只要将这些原发病治愈，肛内不会再有渗液流出刺激肛周皮肤，保持肛周皮肤清洁、干燥，肛门湿疹很可能会自愈。
但也只限于肛门湿疹早期才能自愈，如果肛门湿疹进入到慢性期，也是不能自愈的，所以一定要趁早治疗原发病，肛周湿疹才有自愈的可能。