肛门上有个疙瘩还疼，要前往肛肠外科做相关检查，确诊其病因给予药物治疗，必要时手术治疗。
肛门上的疙瘩疼痛有可能是痔疮引起，特别是血栓性外痔，疼痛比较明显，确诊后可以采取手术治疗，将血栓剥离。再做好局部伤口的消毒换药，配合静脉点滴抗生素抗感染治疗，促进痔疮痊愈，改善疼痛。如果是直肠息肉脱出引起的疼痛，可以通过手术将息肉切除。
如果是肛门尖锐湿疣引起的疙瘩疼痛，可以应用激光或者液态冷冻方式去除，必要时手术治疗。平时要保持肛周局部的清洁、干燥，便后用温水清洗肛门，预防感染。