患有扁桃体发炎的小孩是不建议进行疫苗注射的。进行疫苗注射的副作用，可能会出现发热或者是腹泻的现象。
而扁桃体发炎的小朋友，因体内有炎症，可能会造成小朋友身体的不适，甚至会有一些并发症的症状发生。如果此时进行预防针的注射，可能会因预防针带来的副作用而引起身体出现发烧的症状，或者引起孩子发烧症状加重，不利于孩子疾病的治疗。
因此，建议在孩子扁桃体炎症治愈后，间隔1~2周的时间后再进行疫苗的注射，以免因疫苗注射加重孩子的病情。