唇裂属于先天性疾病，是多基因遗传疾病，具有遗传的风险。
如果本身父母有唇裂发病史，其子女的发病几率要高于正常人，另外曾孕育过唇裂患儿，再次生育，胎儿有唇裂的风险高达2％~4％左右。若家族中唇裂儿童高达2个，其生育风险可以达到10％，建议孕妇在孕育胎儿的过程中，应当进行早期筛查。
除遗传因素外，唇裂的致病因素还包括病毒感染、环境、营养等。若在怀孕期间接触、照射X线或过度抽烟、酗酒，会增加胎儿患有唇裂的几率。