桥本甲亢首选的治疗方法是使用抗甲状腺药物治疗。桥本甲状腺炎是自身免疫性甲状腺疾病的一种，桥本甲状腺炎可以是功能正常的，也可以侵犯到功能出现甲亢或者甲减。
还有很多患者可以自发性的由甲亢逐渐发展成甲减，所以对于桥本甲亢这种患者的治疗，首选抗甲状腺药物治疗，因为抗甲状腺药物治疗是通过药物的方法来抑制甲状腺激素的合成和释放，不会对甲状腺造成完全性的破坏。
桥本甲亢的患者功能亢进不是特别严重，所以抗甲状腺药物的剂量一定要偏小一些。而且在治疗中要注意复查甲功偏勤一些。注意警惕甲亢逐渐发展成甲减，一旦发展成甲减，需要逐渐停止药物使用剂量。必要的时候还有可能需要给予补充甲状腺激素的药物治疗。