龟头湿疹和龟头炎可通过致病诱因、症状，以及实验室辅助检查等手段进行区别。
前者龟头湿疹的致病因素跟敏感物接触有关，特别是过敏体质个体，接触环境中花粉或者是某种特定物质，进食芒果、虾蟹等易致敏物后，龟头部位出现瘙痒、发红等症状，再次接触敏感物，症状可反复发生。
后者龟头炎常由滴虫、真菌、大肠杆菌等感染引起，主要表现是龟头红肿、疼痛等感染症状。局部卫生护理不好、不洁性行为、包皮过长、包茎等容易诱发龟头炎，辅助过敏原检查以及龟头分泌物化验可明确鉴别诊断。