精子畸形是有可能会导致停胎的。
畸形的精子质量不好是不正常的精子，和卵子受孕后形成受精卵，由于受精卵质量不好也有可能会出现胚胎停止。但是，也并不是所有畸形精子都一定会发生胎停，只是发生胎停的几率较高。引起胎停还有可能因为孕酮过低、卵子的质量不好也会引起胚胎停止。
精子畸形率过高需做相关检查，明确引起精子畸形率过高的原因，可以通过用中药调理，注意禁烟、禁酒、规律作息、多锻炼提高精子的活力，提高精子质量再备孕、防止发生胚胎停育。