慢性腹痛并发症有溃疡性结肠炎，以及原发性小肠吸收不良综合征：
1.溃疡性结肠炎，腹痛患者最为常见的并发症就是溃疡性结肠炎，这种情况多数和患者自身免疫力有着极大关系。出现溃疡时，不仅会伴随腹部疼痛，还会出现全身乏力以及食欲不振等特点。
2.原发性小肠吸收不良综合征，这种症状也是慢性肠炎最为常见的并发症之一，当患者出现此情况时，会表现为大便量增多、气味重、色淡等现象。同时还会伴随全身乏力以及腹部胀痛，精神也会受到较为严重的影响。