卵巢的组成结构非常复杂，引起女性出现卵巢囊肿的原因也很多。最常见的就是和遗传以及环境因素的改变，有一定的关系。前面提到卵巢成分比较复杂，他可以在外界的刺激下，向各个细胞方向进行分化，比如说可以分化成上皮性的肿瘤、生殖细胞肿瘤等。此外，卵巢有一个生理特性，就是每个月双侧卵巢都会交替进行排卵。在排卵过后，卵巢表面就会形成缺陷，有可能外界的病菌侵入，引起女性出现炎症，导致卵巢囊肿现象出现。一部分女性排卵之后形成了卵巢的黄体囊肿。部分女性的子宫内膜逆流入盆腔内可以种植在卵巢上，形成卵巢的巧克力囊肿。