尿道炎主要有尿频、尿急、尿痛、血尿以及尿道分泌物等不适后遗症，
症状严重者会明显影响患者工作和生活，有些患者夜间尿频，还会影响睡眠质量。如果治疗不及时，还可能引起邻近居组织器官的炎症，如前列腺炎、精囊炎、宫颈炎、阴道炎、膀胱炎甚至肾盂肾炎。
尿道炎如果是支原体、衣原体、淋球菌等病原微生物引起，还具体性传播倾向，会将这种炎症性疾病传播给性伴侣。如果双方都未及时治疗，还可能会导致尿道感染长期迁延不愈。有些慢性尿道炎的患者病程较长，还可引起一系列心理问题，如焦虑、抑郁症、注意力不集中、失眠等后遗症。