肾脏疼痛主要是指肾脏里面的结石伴随的疼痛，这种疼痛的部位一般是在肾区。同时疼痛非常剧烈，可能伴随有尿路疼痛或者血尿的情况发生。
腰疼是指腰部疼痛，和肾脏疼痛的部位不一样。但是腰疼常见的原因是腰肌劳损、腰椎间盘突出、腰椎管狭窄等等。在腰疼同时还会伴有双下肢的神经症状，一般腰疼同时会伴有双下肢的疼痛、麻木、乏力等情况。
所以肾疼和腰疼的区别在于它们疼痛的部位不一样，疼痛伴随的症状和体征也不一样，还有就是肾脏疼痛做B超检查可能会发现肾积水或者泌尿系统的结石。腰疼的患者腰椎磁共振检查，可能会发现有腰椎间盘突出、腰椎管狭窄、腰椎不稳等等情况。