大多数单纯性甲状腺肿患者，没有明显的病因，部分患者的发病可能与下列因素有关：
1.碘缺乏，碘是合成甲状腺激素的必须元素，碘元素不足，机体不能合成足够的甲状腺激素，反馈刺激垂体促甲状腺激素升高，升高的促甲状腺激素促使甲状腺增生，引起甲状腺肿。
2.酶缺陷，甲状腺激素合成过程中某些酶的先天性缺陷或获得性缺陷可引起单纯性甲状腺肿，如碘化物运输酶缺陷、过氧化物酶缺陷、去卤化酶缺陷、碘酪氨酸耦联酶缺陷等。
3.药物，碘化物、氟化物、锂盐、氨基比林、氨鲁米特、磺胺类、保泰松、胺碘酮、磺胺丁脲、甲巯咪唑、丙基硫氧嘧啶等药物可引起单纯性甲状腺肿。这些药物通过不同的机制，干扰或抑制甲状腺激素合成过程中的各个环节，最终影响甲状腺激素合成，反馈引起促甲状腺激素升高，导致甲状腺肿。
4.吸烟，吸烟可引起单纯性甲状腺肿，因为吸入物中含硫氰酸盐，这是一种致甲状腺肿物质，吸烟者血清甲状腺球蛋白水平要高于非吸烟者。
5.遗传因素，流行病学资料表明，甲状腺肿常常有家族聚集性。另外皮质醇增多症、肢端肥大症及终末期肾脏疾病患者可发生单纯性甲状腺肿。